Em dic Alfons Nonell i Canals i actualment treballo com a investigador postdoctoral al grup de Recerca en Quimiogenòmica (CGL), de l’Insitut Municipal d’Investigació Mèdica (IMIM) i la Universitat Pompeu Fabra (UPF). Sóc llicènciat en Farmàcia per la Universitat de Barcelona (2003) i doctor en Química Teòrica i Computacional per la Universitat Rovira i Virgili (2008). M’interessa tot allò que faci tirar endavant la ciència i a la vegada la faci més humana i posi els seus avenços al servei de la societat.

A banda d’aquest bloc, en tinc un parell més, “El meu dip“, de caire generalista i “Què hi diu el pare?“, on parlo de les vivències de ser pare novell.

Recerca

Actualment la meva recerca se centra en la programació i desenvolupament de metodologies per l’exploració de l’espai químic. Això inclou desenvolupament d’algoritmes per a mutar molècules, gestió de grans bases de dades de molècules (ja siguin comercials com “virtuals”) i la implementació d’eines ja existents per al càlcul de descriptors moleculars i pel perfilat virtual de molècules.

Paral·lelament al meu projecte principal, una de les tasques quedut a terme el darrer any i mig ha estat col·laborar en la coordinació d’un work package d’un projecte europeu en el que participa l’UPF i que s’anomena CancerGRID.

La tesi, titulada “Qm and qm/mm studies on organic and bioinorganic systems” (i que podeu trobar al repositori de Tesis Doctorals in Xarxa) se centrava en l’aplicació de mètodes de mecànica quàntica (QM) i mètodes híbrids mecànica quàntica/mecànica molecular (QM/MM) en l’estudi de problemes química i bioquímics reals. Així doncs, vaig estudiar l’efecte de la selenocisteïna en el centre actiu dels enzims Formiat Deshidrogenasa, l’estudi de la síntesi de 4-helicenequinones i 5-helicens i, finalment, a l’ús del grup funcional guanidini com a catal·litzador. La tesi la vaig realitzar sota la direcció del Prof. Feliu Maseras i el Dr. Jordi Villà i Freixa.

Informàtica

Sóc farmacèutic de formació i quimioinformàtic de professió. Treballo bàsicament amb programari lliure, m’agrada com funciona, em va molt bé i em facilita la feina. Crec que puc dir que domino els sistemes Linux a nivell d’administrador. Pel que fa als llenguatges de programació, treballo bàsicament amb Python, PHP, i alguna coseta amb Perl i Fortran. Com a bases de dades, faig servir mySQL.

Les eines lliures que més empro són l’OpenBabel (i el seu conjunt de llibreries per Python Pybel), R (pel tractament estadístic) i el “vi”, el millor editor (tot i que els fans de l’eMacs ens diran que emprar vi és una penitència).