Em dic Alfons Nonell i Canals i actualment treballo com a investigador postdoctoral al grup de Recerca en Quimiogenòmica (CGL), de l’Insitut Municipal d’Investigació Mèdica (IMIM) i la Universitat Pompeu Fabra (UPF). Sóc llicènciat en Farmàcia per la Universitat de Barcelona (2003) i doctor en Química Teòrica i Computacional per la Universitat Rovira i Virgili (2008). M’interessa tot allò que faci tirar endavant la ciència i a la vegada la faci més humana i posi els seus avenços al servei de la societat.

A banda d’aquest bloc, en tinc un parell més, “El meu dip“, de caire generalista i “Què hi diu el pare?“, on parlo de les vivències de ser pare novell.

Recerca

Actualment la meva recerca se centra en la programació i desenvolupament de metodologies per l’exploració de l’espai químic. Això inclou desenvolupament d’algoritmes per a mutar molècules, gestió de grans bases de dades de molècules (ja siguin comercials com “virtuals”) i la implementació d’eines ja existents per al càlcul de descriptors moleculars i pel perfilat virtual de molècules.

Paral·lelament al meu projecte principal, una de les tasques que faig actualment és la de coordinació d’un work package d’un projecte europeu en el que participa l’UPF i que s’anomena CancerGRID.

La tesi, titulada “Qm and qm/mm studies on organic and bioinorganic systems” (i que podeu trobar al repositori de Tesis Doctorals in Xarxa) se centrava en l’aplicació de mètodes de mecànica quàntica (QM) i mètodes híbrids mecànica quàntica/mecànica molecular (QM/MM) en l’estudi de problemes química i bioquímics reals. Així doncs, vaig estudiar l’efecte de la selenocisteïna en el centre actiu dels enzims Formiat Deshidrogenasa, l’estudi de la síntesi de 4-helicenequinones i 5-helicens i, finalment, a l’ús del grup funcional guanidini com a catal·litzador. La tesi la vaig realitzar sota la direcció del Prof. Feliu Maseras i el Dr. Jordi Villà i Freixa.

Informàtica

Sóc farmacèutic de formació i quimioinformàtic de professió. Treballo bàsicament amb programari lliure, m’agrada com funciona, em va molt bé i em facilita la feina. Crec que puc dir que domino els sistemes Linux a nivell d’administrador. Pel que fa als llenguatges de programació, treballo bàsicament amb Python, PHP, i alguna coseta amb Perl i Fortran. Com a bases de dades, faig servir mySQL.

Les eines lliures que més empro són l’OpenBabel (i el seu conjunt de llibreries per Python Pybel), R (pel tractament estadístic) i el “vi”, el millor editor (tot i que els fans de l’eMacs ens diran que emprar vi és una penitència).