Fa molt temps ja (anys!) que tinc el php com a llenguatge de referència per a fer les meves webs (i aplicacions web). És un llenguatge que corre al servidor i origina un HTML que entén el navegador. L’aventatge que té és que permet “programar”, fer quelcom més que un simple HTML. Connecta amb bases de dades, interacciona amb el sistema (podent executar, fins i tot, programes externs), pots “programar” petites aplicacions,… en fi, genial! i tot ben lliure!

Però darrerament li estic trobant una bona utilitat més enllà del navegador. Fa temps que existeixen projectes com BioPerl, BioJava, BioPhyton i… fins i tot, BioPhp (una mica apagat des de bon principi). Sempre que m’havia de programar quelcom per treballar amb resultats (extreure energies, coordenades dels àtoms, manipular resultats d’un Blast,… ) em feia els meus programets en Perl. M’anava bé. Però, com que ho feia de tant en tant, sempre  que m’hi posava havia de refrescar massa la memòria.

Ara fa uns dies que he provat de fer totes aquestes coses: fer ús del php com a llenguatge scripting i executar-lo des d’una shell. Primer va ser un script molt “tonto” per escriure uns fitxers d’entrada, però poc a poc m’he anat animant i puc dir que estic gratament sorprès dels resultats. Si bé no he dubtat mai de la potència d’aquest llenguatge en el món d’internet, mai l’havia posat a prova (realment) fora del servidor, l’experiència no m’ha decebut. Primer de tot, per que és un llenguatge que, més o  menys, domino. Segon, em permet fer tot allò que necessito: llegir i escriure fitxers, operar, manipular dades, interacutar amb funcions pròpies del sistema (fer greps i similars),…

No puc dir que m’inclogui dins la gent del BioPhp (dedicat a la bioinformàtica), però si a un ChemBioPhp o, éssent més general: ScientificPhp :-)